Els mètodes de refrigeració habituals que s'utilitzen a les màquines de-congelació ràpida inclouen els següents:
Refrigeració per compressor: aquest és el mètode més comú. Utilitza un compressor per comprimir el refrigerant en un gas d'alta-temperatura i alta-pressió, que després es condensa en un líquid mitjançant un condensador. Després de ser despresuritzat per un dispositiu d'acceleració, entra a l'evaporador, absorbint la calor de l'entorn per aconseguir el refredament. Aquest mètode és altament eficient, tecnològicament madur i permet un control precís de la temperatura, per la qual cosa és àmpliament utilitzat en diversos tipus de màquines de congelació ràpida-.
Refrigeració amb nitrogen líquid: el nitrogen líquid té una temperatura extremadament baixa. Quan s'injecta a la màquina de-congelació ràpida, el nitrogen líquid es vaporitza ràpidament, absorbint una gran quantitat de calor i refredant ràpidament els aliments. Aquest mètode de refrigeració proporciona un refredament extremadament ràpid i pot preservar els components nutricionals i el gust dels aliments en la màxima mesura.
Refrigeració amb gel sec: el gel sec sublima i absorbeix una gran quantitat de calor, aconseguint així el refredament. La refrigeració amb gel sec és convenient d'utilitzar i no requereix cap equipament complex.
